Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCOLN1Q9GZU1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCOLN1Q9GZU1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms