Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LNPKQ9C0E8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LNPKQ9C0E8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LNPKQ9C0E8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms