Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NMES1Q9C002 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NMES1Q9C002 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms