Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PUS3Q9BZE2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms