Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM55Q9BYV6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms