Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRIM54Q9BYV2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM54Q9BYV2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms