Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC46A2Q9BY10 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms