Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GATA5Q9BWX5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GATA5Q9BWX5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms