Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC106Q9BWC9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC106Q9BWC9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms