Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC94Q9BW85 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms