Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TUBB6Q9BUF5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TUBB6Q9BUF5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms