Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C2orf88Q9BSF0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C2orf88Q9BSF0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms