Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIKE1Q9BRV8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SIKE1Q9BRV8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms