Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAAF1Q9BRP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAAF1Q9BRP4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms