Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RHOXF2Q9BQY4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOXF2Q9BQY4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms