Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.76■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FYCO1Q9BQS8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FYCO1Q9BQS8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms