Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PMCHL2Q9BQD1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PMCHL2Q9BQD1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms