Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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KCNS3Q9BQ31 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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KCNS3Q9BQ31 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
KCNS3Q9BQ31 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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KCNS3Q9BQ31 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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KCNS3Q9BQ31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KCNS3Q9BQ31 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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