Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED1Q99966 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms