Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN18Q99952 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms