Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GABRG3Q99928 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GABRG3Q99928 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms