Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHP1Q99653 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHP1Q99653 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms