Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NAP1L3Q99457 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAP1L3Q99457 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAP1L3Q99457 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms