Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
IFT140Q96RY7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
IFT140Q96RY7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
IFT140Q96RY7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms