Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ACCSQ96QU6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACCSQ96QU6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms