Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GCNAQ96QF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNAQ96QF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms