Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LMTK3Q96Q04 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
LMTK3Q96Q04 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms