Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGAP3Q96P47 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGAP3Q96P47 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms