Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC115Q96NT0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC115Q96NT0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms