Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF558Q96NG5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF558Q96NG5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms