Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF396Q96N95 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF396Q96N95 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms