Protein–RNA interactions for Protein: Q96MM3

ZFP42, Zinc finger protein 42 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP42Q96MM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZFP42Q96MM3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZFP42Q96MM3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZFP42Q96MM3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms