Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CNBD2Q96M20 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CNBD2Q96M20 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms