Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SENP8Q96LD8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SENP8Q96LD8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms