Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPGRIP1Q96KN7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPGRIP1Q96KN7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms