Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MED8Q96G25 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MED8Q96G25 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms