Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BICD1Q96G01 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BICD1Q96G01 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms