Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM44Q96DX7 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM44Q96DX7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms