Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG4CQ96DT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG4CQ96DT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms