Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HDAC11Q96DB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDAC11Q96DB2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms