Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VOPP1Q96AW1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VOPP1Q96AW1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms