Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MKL1Q969V6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MKL1Q969V6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MKL1Q969V6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms