Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RNF34Q969K3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms