Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMARCE1Q969G3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMARCE1Q969G3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms