Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
CSRNP3Q8WYN3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms