Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
COPS9Q8WXC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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COPS9Q8WXC6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS9Q8WXC6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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