Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UBLCP1Q8WVY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBLCP1Q8WVY7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBLCP1Q8WVY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UBLCP1Q8WVY7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UBLCP1Q8WVY7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBLCP1Q8WVY7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms