Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GIPC3Q8TF64 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GIPC3Q8TF64 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms