Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MDM1Q8TC05 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MDM1Q8TC05 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 481.4 ms