Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBZ0

CCDC110, Coiled-coil domain-containing protein 110, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC110Q8TBZ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC110Q8TBZ0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC110Q8TBZ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms